Nie zalecamy instalacji programu SkanDok SQL na darmowej wersji Express. Jej ograniczenia co do wielkości bazy mogą spowodować szybkie jej zapełnienie na skutetek podpinania plików skanowanych dokumentów co w efekcie może sparaliżować pracę kancelarii. Program SkanDok SQL wymaga instalacji pełnego servera baz danych SQL.